蛋白质构象分析旨在深入解析蛋白质的三级结构及其动态变化。蛋白质构象是指蛋白质分子中原子的三维空间排列方式。三级结构是指在二级结构的基础上，多肽链进一步折叠形成的具有特定空间形状的三维结构。三级结构的稳定主要靠非共价键，如氢键、离子键、疏水作用和范德华力等，也有部分蛋白质通过共价键（如二硫键）来稳定结构。蛋白质的功能与其构象密切相关，正确的构象是蛋白质发挥生物学功能的基础。例如，酶的活性中心需要特定的构象来结合底物并催化反应；抗体的抗原结合部位也需要特定的构象来识别和结合抗原。即使是蛋白质的构象发生微小的变化，也可能导致其功能的丧失或改变。蛋白质的结构决定其生物功能，一个微小的构象变化可能导致功能的显著变化。例如，许多疾病如阿尔茨海默病、帕金森病等，都与特定蛋白质的异常构象有关。通过构象分析，研究人员可以识别这些异常，进而为疾病机制的探讨提供线索。其次，蛋白质构象分析在药物设计中具有应用。药物通常通过与特定蛋白质结合来发挥作用，而这种结合的有效性依赖于蛋白质的构象。因此，了解目标蛋白质的结构特征能够指导药物分子的设计与优化，提高药物的靶向性和疗效。此外，蛋白质构象分析还在生物工程中应用广泛，如酶工程中，通过构象分析可以优化酶的活性、稳定性和特异性，为工业生产提供高效的生物催化剂。

一、蛋白质构象分析的常见方法

1、X射线晶体学

基于晶体中原子对 X - 射线的衍射现象，通过分析蛋白质晶体所衍射的X射线来确定蛋白质三维结构。当一束 X - 射线照射到蛋白质晶体时，晶体中的原子会使 X - 射线发生散射，这些散射的 X - 射线在某些方向上会产生干涉现象，形成衍射斑点。通过收集和分析这些衍射斑点的位置、强度等信息，可以构建出蛋白质原子的三维坐标，从而得到蛋白质的结构。

2、核磁共振波谱(NMR)

NMR 是基于原子核的磁性。在强磁场中，蛋白质分子中的某些原子核（如 1H、13C、15N 等）会产生磁共振现象。当施加射频脉冲时，这些原子核会吸收能量并发生共振跃迁，当射频脉冲停止后，原子核会释放能量回到基态，这个过程会产生可以被检测到的 NMR 信号。不同原子核之间的距离和化学键的角度等信息可以通过分析这些信号的化学位移、偶合常数、核欧沃豪斯效应（NOE）等来获得，进而构建蛋白质的三维结构。

3、冷冻电子显微镜(Cryo-EM)

冷冻电镜是将蛋白质样品快速冷冻在一层玻璃态的冰中，然后在电子显微镜下观察。电子束穿过样品时会产生散射，这些散射电子被探测器收集并形成图像。通过对大量的二维图像进行分析和三维重建，可以得到蛋白质的三维结构。

4、圆二色性光谱（CD）法

圆二色性是指手性分子对左右圆偏振光吸收程度不同的现象。蛋白质中的二级结构（α - 螺旋、β - 折叠、β - 转角和无规卷曲）具有手性，会产生圆二色性。不同的二级结构在不同的波长范围内会产生特定的 CD 信号，例如 α - 螺旋在 208nm 和 222nm 处有特征吸收峰，β - 折叠在 217nm 左右有吸收峰。通过测量蛋白质溶液在远紫外区（190 - 250nm）的 CD 光谱，可以推断蛋白质的二级结构组成和大致比例。

5、荧光光谱法

许多蛋白质本身含有天然荧光团（如色氨酸、酪氨酸等），这些荧光团在受到特定波长的光激发后会发射出荧光。蛋白质的构象变化会影响荧光团的微环境，从而改变荧光的发射强度、波长和寿命等参数。另外，也可以通过向蛋白质中引入外源性荧光探针来研究蛋白质构象。例如，一些荧光探针可以特异性地结合到蛋白质的某些位点，当蛋白质构象发生变化时，荧光探针的荧光性质也会随之改变。

百泰派克生物科技在蛋白质构象分析领域提供专业的分析服务，为客户提供从样品制备到数据解析的一站式解决方案。我们拥有经验丰富的科学团队，致力于通过精确的蛋白质结构解析，为您的科研项目提供强有力的支持，帮助您在生物科技领域取得突破性进展。欢迎与我们合作。

百泰派克生物科技特色项目

一、蛋白测序

百泰派克生物科技使用Thermo公司新推出的Obitrap Fusion Lumos质谱仪及岛津公司埃德曼降解测序系统对蛋白质序列进行分析，提供基于质谱的蛋白测序分析服务，包括对蛋白质的氨基酸组成分析，N端测序，C端测序和全序列分析，以及基于埃德曼降解的蛋白质N端序列分析服务。对于未知理论序列的蛋白质，提供基于从头测序法的蛋白质从头测序服务，对蛋白序列进行分析。

※服务优势：

1.采用目前世界上先进的质谱仪器 Obitrap Fusion Lumos;

2.可实现对所测定靶蛋白序列 100% 的覆盖;

3.可测定蛋白N端多达 70个氨基酸序列;

4.可测定多种形式的样品: 蛋白溶液、PVDF 蛋白条带;

5.样品用量低: 蛋白样品仅需 5-10ug，即可完成检测;

6.测序不受N端封闭，PEC和和糖基化等N端修饰的影响。

二、蛋白质组学

百泰派克生物科技采用Thermo Fisher的Orbitrap Fusion Lumos质谱平台结合Nano-LC，提供定量蛋白质组学、靶向蛋白质组学、多肽组学、翻译后修饰蛋白组学等多种蛋白质组学分析服务。此外，百泰派克生物科技新推出基于timsTOF Pro的4D蛋白质组学服务，助力微量样本蛋白组学、大样本群医学及高通量修饰组学等研究工作。

※服务优势：

1 .高通量定量蛋白分析:多对照组大规模实验分析，发现新的生物标记物;

2.体内体外多种蛋白质标记方法，适用于分析组织、细胞、血液等多种样品;

3.质谱分析灵敏度高，实验结果重复度高;

4.可检测较低丰度蛋白，线性范围广;

5.专业生物信息学分析，分析更系统准确。

三、单细胞质谱流式技术分析

百泰派克生物科技采用Fluidigm质谱流式系统进行单细胞质谱流式技术分析，采用金属元素标记物（通常是金属元素标记的特异抗体）标记细胞表面和内部的分子，然后用流式细胞原理分离单个细胞，再用电感耦合等离子体质谱（ICP-MS）分析单个细胞的原子质量谱，最后将原子质量谱数据转换为细胞表面和内部的信号分子表达量。

※服务优势：

1.技术先进，填补技术空白

采用金属标记抗体技术，避免了传统流式荧光通道少且易相互影响的问题。可在单细胞层面上对多种指标同时进行表征，百泰派克生物科技可做到同时检测51个目标蛋白。

2.分析数量大，成本较低

单细胞RNAseq受成本等因素限制，所有样本细胞汇总的分析数目一般在2x10^4个左右，而流式质谱技术一次（单样本）就可分析至少10^5的细胞，实现了数量级的提高，且成本不高于单细胞RNAseq。

3.应用前景大

①流式质谱结果可以给出细胞亚群的变化，在临床诊断、疾病机制研究等方面具有极大的研究前景；

②将金属标签技术与其他技术结合会有新应用方向。除常规蛋白外，质谱流式细胞技术还可用于蛋白翻译后修饰；

③可检测细胞存活率、细胞大小、mRNA转录子表达量、DNA合成速率以及蛋白酶活性等。

四、基于高精度质谱的免疫多肽组学分析及新抗原发现

百泰派克生物科技的基于高精度质谱的免疫多肽组学分析及新抗原发现一站式解决方案包括我们专有的、高度敏感的免疫肽富集和鉴定方案。我们能够帮助您实现10,000个以上I型多肽和10,000个以上II型多肽的鉴定和识别。通过我们优化的高通量免疫多肽组学分析平台进行免疫肽组学分析，可从最小的样品材料中进行可重复的识别和定量。该服务可以应用于大规模的研究，旨在助力科研工作者寻找癌症、免疫疾病及传染病的解决方案，深入挖掘未知的靶标。

五、生物药物表征

百泰派克基于高分辨率质谱技术，MALDI TOF，高效色谱分离技术，提供一系列完善的生物药物分析方案，从蛋白质、多肽、抗体、疫苗等生物制品的氨基酸组成和一级结构分析，到产品变异性和纯度分析。旨在提供优质生物药物分析服务，帮助生物医药生产商提高生物药物品质。

百泰派克生物科技七大检测平台

百泰派克生物科技-生物制品表征，生物质谱多组学优质服务商

北京百泰派克生物科技有限公司致力于为生物/制药和医疗器械行业提供质量控制检测和项目验证等专业服务。公司实验室遵循NMPA、ICH、FDA和EMA等的法规和指导原则，通过CNAS/ISO9001双重质量体系认证，建立了完备的质量体系，数据冷热/异地备份，设备定期计量/期间核查，软件审计追踪，为客户提供一体化解决方案和技术服务，支持新药研发、药物申报注册和生产放行。

1.公司采用ISO9001质量控制体系，专业提供以质谱为基础的CRO检测分析服务；

2.获国家CNAS实验室认可，为客户提供符合全球药政法规的药物质量研究服务；

3.业务范围覆盖蛋白质组学、多肽组学、代谢组学、生物药物表征、单细胞分析、单细胞质谱流式、生信云分析以及多组学生物质谱整合分析等；

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